先让蛋白质连续：
gmx trjconv -f name.gro -s name.tpr -o temp1.gro -pbc cluster
选择蛋白质组进行cluster处理
再处理整个体系保持膜结构：
gmx trjconv -f temp1.gro -s name.tpr -o final.gro -pbc mol -center解决Charmm-gui生成的Z轴过大的膜蛋白体系无法正常处理PBC的小命令
由 James-Li 撰写
最后修改于
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