1 安装openmpi

sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev openssh-client

2 安装Anaconda

//从tuna下载最新版本anconda安装包并放入目录下,根据架构选择版本，一般下载Linux-x86_64.sh版本

chmod +x [sh的文件名]
./[sh的文件名] #注意最后需要输入yes将conda加入PATH

3 安装并启用gmxmmpbsa

点击下载yml文件
将yml文件重命名为gmxmmpbsa.yaml并放置于目录下

conda env create -f gmxmmpbsa
conda activate mmpbsa

4 安装ambertools

conda install -c conda-forge ambertools

5 安装Qt

pip install PyQt5 -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
pip install pyqt6 -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

6 安装gmx_mmpbsa

python -m pip install gmx_MMPBSA

7 更新

python -m pip install gmx_MMPBSA -U